GGBI mempunyai keyakinan iman sebagai berikut:

1. Allah yang Mahakuasa, Pencipta Langit dan Bumi adalah Allah Tritunggal yaitu Bapa, Anak, dan Roh Kudus.
2. Tuhan Yesus Kristus adalah satu-satunya Juruselamat manusia dan setiap orang dapat datang langsung kepada-Nya.
3. Roh Kudus adalah pemberi kuasa, karunia, dan pembimbing dalam kehidupan orang percaya dan dalam pemberitaan Injil.
4. Alkitab adalah Firman Allah yang merupakan pedoman tertinggi bagi iman dan kehidupan umat.
5. Gereja Baptis Indonesia sebagai persekutuan setempat orang-orang percaya bersifat otonom dan berpemerintahan kongregasional yang terikat dengan gereja-gereja Baptis Indonesia lainnya dalam wadah keluarga besar Umat Baptis Indonesia.
6. Gereja dan Negara masing-masing berkedudukan tersendiri namun saling melengkapi dalam membentuk manusia seutuhnya.
7. Pada hari akhir Tuhan Yesus Kristus akan datang kembali.